过去因为进行称为「侦探」的推理活动，经历痛苦回忆的小鸠，下定决心要当一个低调不起眼的小市民。他与志同道合的同学小佐内私底下结成「互惠关系」，打算在高中营造小市民的形象，度过安稳的生活，但是不知为何，神秘的事件和灾难总是接二连三降临到他们的校园生活中。小鸠和小佐内真的能作为小市民过上安稳的生活吗？

高中二年级的小鸠与长内结束了互惠互利的关系。长井开始与报社一年级会员乌拉诺斯约会。为了留下自己上过学的证据，也为了给长内留下好印象，上野努力让学校报刊登发生在该市的一起纵火事件。与此同时，小羽开始和他的同学中丸约会。原本过着平静生活的他，却突然发现河岸边发生了纵火事件……作为普通人重新开始的小鸠君和长内同学，又会发生怎样的故事呢？